Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC2Q13868 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC2Q13868 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXOSC2Q13868 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EXOSC2Q13868 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC2Q13868 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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