Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH12P55289 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH12P55289 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH12P55289 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH12P55289 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH12P55289 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH12P55289 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH12P55289 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH12P55289 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH12P55289 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH12P55289 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH12P55289 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH12P55289 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH12P55289 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH12P55289 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH12P55289 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH12P55289 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH12P55289 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH12P55289 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH12P55289 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH12P55289 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH12P55289 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH12P55289 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH12P55289 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH12P55289 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH12P55289 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH12P55289 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH12P55289 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH12P55289 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH12P55289 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH12P55289 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH12P55289 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH12P55289 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH12P55289 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH12P55289 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH12P55289 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH12P55289 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH12P55289 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH12P55289 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH12P55289 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH12P55289 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH12P55289 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH12P55289 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH12P55289 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH12P55289 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH12P55289 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH12P55289 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH12P55289 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH12P55289 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH12P55289 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH12P55289 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH12P55289 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH12P55289 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH12P55289 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH12P55289 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH12P55289 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH12P55289 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH12P55289 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH12P55289 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH12P55289 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH12P55289 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH12P55289 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH12P55289 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH12P55289 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH12P55289 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH12P55289 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH12P55289 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH12P55289 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH12P55289 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH12P55289 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH12P55289 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH12P55289 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH12P55289 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH12P55289 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH12P55289 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH12P55289 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH12P55289 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH12P55289 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH12P55289 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH12P55289 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH12P55289 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH12P55289 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH12P55289 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH12P55289 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH12P55289 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH12P55289 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH12P55289 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH12P55289 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH12P55289 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH12P55289 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH12P55289 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH12P55289 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH12P55289 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH12P55289 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH12P55289 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH12P55289 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH12P55289 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH12P55289 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH12P55289 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH12P55289 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms