Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CDH12P55289 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDH12P55289 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CDH12P55289 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CDH12P55289 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CDH12P55289 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CDH12P55289 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CDH12P55289 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDH12P55289 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDH12P55289 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDH12P55289 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDH12P55289 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDH12P55289 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDH12P55289 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CDH12P55289 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDH12P55289 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDH12P55289 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CDH12P55289 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDH12P55289 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDH12P55289 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CDH12P55289 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDH12P55289 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDH12P55289 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDH12P55289 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDH12P55289 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CDH12P55289 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDH12P55289 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH12P55289 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDH12P55289 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDH12P55289 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDH12P55289 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH12P55289 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH12P55289 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH12P55289 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDH12P55289 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDH12P55289 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH12P55289 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH12P55289 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDH12P55289 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH12P55289 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH12P55289 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH12P55289 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH12P55289 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDH12P55289 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH12P55289 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDH12P55289 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDH12P55289 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH12P55289 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDH12P55289 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH12P55289 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH12P55289 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH12P55289 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH12P55289 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH12P55289 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDH12P55289 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH12P55289 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDH12P55289 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDH12P55289 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDH12P55289 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH12P55289 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH12P55289 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH12P55289 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDH12P55289 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH12P55289 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH12P55289 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH12P55289 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH12P55289 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH12P55289 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH12P55289 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH12P55289 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH12P55289 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH12P55289 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH12P55289 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH12P55289 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH12P55289 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH12P55289 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH12P55289 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH12P55289 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH12P55289 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH12P55289 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH12P55289 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH12P55289 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDH12P55289 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH12P55289 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH12P55289 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH12P55289 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH12P55289 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH12P55289 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH12P55289 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH12P55289 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH12P55289 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH12P55289 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH12P55289 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH12P55289 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH12P55289 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH12P55289 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH12P55289 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH12P55289 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH12P55289 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH12P55289 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms