Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MFAP3P55082 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MFAP3P55082 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MFAP3P55082 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MFAP3P55082 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MFAP3P55082 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MFAP3P55082 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms