Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
MFAP3P55082 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
MFAP3P55082 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
MFAP3P55082 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
MFAP3P55082 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
MFAP3P55082 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MFAP3P55082 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MFAP3P55082 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MFAP3P55082 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MFAP3P55082 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MFAP3P55082 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
MFAP3P55082 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MFAP3P55082 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
MFAP3P55082 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MFAP3P55082 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MFAP3P55082 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MFAP3P55082 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MFAP3P55082 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MFAP3P55082 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MFAP3P55082 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MFAP3P55082 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MFAP3P55082 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MFAP3P55082 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MFAP3P55082 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MFAP3P55082 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MFAP3P55082 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MFAP3P55082 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MFAP3P55082 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
MFAP3P55082 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
MFAP3P55082 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MFAP3P55082 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MFAP3P55082 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MFAP3P55082 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MFAP3P55082 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MFAP3P55082 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MFAP3P55082 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
MFAP3P55082 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MFAP3P55082 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MFAP3P55082 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MFAP3P55082 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MFAP3P55082 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MFAP3P55082 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MFAP3P55082 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MFAP3P55082 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MFAP3P55082 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MFAP3P55082 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
MFAP3P55082 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MFAP3P55082 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MFAP3P55082 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MFAP3P55082 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MFAP3P55082 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MFAP3P55082 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MFAP3P55082 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MFAP3P55082 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MFAP3P55082 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MFAP3P55082 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MFAP3P55082 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MFAP3P55082 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MFAP3P55082 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
MFAP3P55082 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MFAP3P55082 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MFAP3P55082 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
MFAP3P55082 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
MFAP3P55082 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MFAP3P55082 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MFAP3P55082 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MFAP3P55082 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MFAP3P55082 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MFAP3P55082 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
MFAP3P55082 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MFAP3P55082 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MFAP3P55082 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MFAP3P55082 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MFAP3P55082 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MFAP3P55082 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MFAP3P55082 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
MFAP3P55082 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
MFAP3P55082 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MFAP3P55082 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MFAP3P55082 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MFAP3P55082 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MFAP3P55082 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
MFAP3P55082 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MFAP3P55082 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MFAP3P55082 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MFAP3P55082 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
MFAP3P55082 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MFAP3P55082 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MFAP3P55082 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MFAP3P55082 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MFAP3P55082 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MFAP3P55082 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
MFAP3P55082 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
MFAP3P55082 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
MFAP3P55082 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MFAP3P55082 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MFAP3P55082 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MFAP3P55082 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MFAP3P55082 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
MFAP3P55082 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms