Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARFIP1P53367 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFIP1P53367 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFIP1P53367 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFIP1P53367 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARFIP1P53367 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARFIP1P53367 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms