Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GALR1P47211 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GALR1P47211 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GALR1P47211 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GALR1P47211 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GALR1P47211 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GALR1P47211 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GALR1P47211 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GALR1P47211 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GALR1P47211 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GALR1P47211 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GALR1P47211 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GALR1P47211 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GALR1P47211 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GALR1P47211 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GALR1P47211 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GALR1P47211 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GALR1P47211 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GALR1P47211 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GALR1P47211 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GALR1P47211 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GALR1P47211 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GALR1P47211 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GALR1P47211 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GALR1P47211 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GALR1P47211 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GALR1P47211 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GALR1P47211 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GALR1P47211 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GALR1P47211 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GALR1P47211 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GALR1P47211 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GALR1P47211 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GALR1P47211 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GALR1P47211 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GALR1P47211 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GALR1P47211 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GALR1P47211 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GALR1P47211 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GALR1P47211 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GALR1P47211 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GALR1P47211 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GALR1P47211 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GALR1P47211 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GALR1P47211 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GALR1P47211 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GALR1P47211 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GALR1P47211 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GALR1P47211 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GALR1P47211 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GALR1P47211 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GALR1P47211 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GALR1P47211 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GALR1P47211 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GALR1P47211 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GALR1P47211 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GALR1P47211 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GALR1P47211 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GALR1P47211 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GALR1P47211 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GALR1P47211 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GALR1P47211 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GALR1P47211 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GALR1P47211 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GALR1P47211 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GALR1P47211 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GALR1P47211 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GALR1P47211 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GALR1P47211 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GALR1P47211 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GALR1P47211 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GALR1P47211 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GALR1P47211 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALR1P47211 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALR1P47211 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALR1P47211 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GALR1P47211 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GALR1P47211 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALR1P47211 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALR1P47211 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALR1P47211 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALR1P47211 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALR1P47211 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALR1P47211 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALR1P47211 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALR1P47211 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALR1P47211 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALR1P47211 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALR1P47211 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALR1P47211 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALR1P47211 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALR1P47211 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALR1P47211 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALR1P47211 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALR1P47211 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALR1P47211 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALR1P47211 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALR1P47211 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALR1P47211 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALR1P47211 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms