Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX11P35716 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX11P35716 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX11P35716 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX11P35716 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX11P35716 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX11P35716 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX11P35716 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX11P35716 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX11P35716 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX11P35716 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX11P35716 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX11P35716 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SOX11P35716 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX11P35716 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SOX11P35716 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX11P35716 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX11P35716 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX11P35716 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX11P35716 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX11P35716 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX11P35716 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SOX11P35716 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX11P35716 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX11P35716 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX11P35716 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX11P35716 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX11P35716 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX11P35716 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX11P35716 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX11P35716 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX11P35716 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX11P35716 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX11P35716 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX11P35716 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX11P35716 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX11P35716 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX11P35716 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX11P35716 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX11P35716 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX11P35716 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOX11P35716 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SOX11P35716 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOX11P35716 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOX11P35716 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX11P35716 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX11P35716 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX11P35716 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX11P35716 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOX11P35716 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX11P35716 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX11P35716 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX11P35716 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOX11P35716 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOX11P35716 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX11P35716 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX11P35716 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX11P35716 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOX11P35716 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX11P35716 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOX11P35716 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOX11P35716 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX11P35716 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX11P35716 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX11P35716 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX11P35716 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOX11P35716 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX11P35716 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOX11P35716 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SOX11P35716 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX11P35716 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX11P35716 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX11P35716 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX11P35716 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX11P35716 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX11P35716 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX11P35716 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOX11P35716 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX11P35716 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX11P35716 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOX11P35716 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX11P35716 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX11P35716 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOX11P35716 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOX11P35716 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX11P35716 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX11P35716 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOX11P35716 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX11P35716 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX11P35716 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX11P35716 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOX11P35716 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX11P35716 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOX11P35716 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOX11P35716 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX11P35716 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX11P35716 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX11P35716 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOX11P35716 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOX11P35716 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms