Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RDXP35241 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RDXP35241 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RDXP35241 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RDXP35241 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RDXP35241 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RDXP35241 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RDXP35241 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDXP35241 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RDXP35241 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDXP35241 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDXP35241 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RDXP35241 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RDXP35241 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RDXP35241 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RDXP35241 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RDXP35241 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RDXP35241 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RDXP35241 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RDXP35241 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RDXP35241 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RDXP35241 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RDXP35241 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RDXP35241 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RDXP35241 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RDXP35241 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RDXP35241 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RDXP35241 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RDXP35241 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RDXP35241 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RDXP35241 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RDXP35241 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RDXP35241 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RDXP35241 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RDXP35241 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RDXP35241 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RDXP35241 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RDXP35241 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RDXP35241 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RDXP35241 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDXP35241 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDXP35241 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDXP35241 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDXP35241 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDXP35241 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RDXP35241 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RDXP35241 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RDXP35241 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RDXP35241 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RDXP35241 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RDXP35241 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RDXP35241 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RDXP35241 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RDXP35241 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RDXP35241 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RDXP35241 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RDXP35241 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RDXP35241 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RDXP35241 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RDXP35241 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RDXP35241 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RDXP35241 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RDXP35241 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RDXP35241 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RDXP35241 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RDXP35241 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RDXP35241 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RDXP35241 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RDXP35241 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RDXP35241 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RDXP35241 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RDXP35241 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RDXP35241 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RDXP35241 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RDXP35241 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RDXP35241 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RDXP35241 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RDXP35241 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RDXP35241 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RDXP35241 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RDXP35241 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RDXP35241 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RDXP35241 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RDXP35241 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RDXP35241 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RDXP35241 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RDXP35241 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RDXP35241 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RDXP35241 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RDXP35241 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RDXP35241 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDXP35241 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDXP35241 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDXP35241 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RDXP35241 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RDXP35241 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RDXP35241 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RDXP35241 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RDXP35241 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RDXP35241 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms