Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD6P30203 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD6P30203 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD6P30203 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CD6P30203 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD6P30203 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD6P30203 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CD6P30203 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD6P30203 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CD6P30203 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD6P30203 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD6P30203 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CD6P30203 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD6P30203 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CD6P30203 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CD6P30203 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD6P30203 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD6P30203 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD6P30203 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CD6P30203 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD6P30203 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD6P30203 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD6P30203 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD6P30203 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CD6P30203 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CD6P30203 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD6P30203 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CD6P30203 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CD6P30203 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD6P30203 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD6P30203 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD6P30203 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD6P30203 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD6P30203 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD6P30203 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CD6P30203 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CD6P30203 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD6P30203 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CD6P30203 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD6P30203 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD6P30203 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD6P30203 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD6P30203 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD6P30203 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD6P30203 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CD6P30203 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD6P30203 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CD6P30203 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD6P30203 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD6P30203 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CD6P30203 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CD6P30203 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD6P30203 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CD6P30203 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD6P30203 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD6P30203 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD6P30203 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD6P30203 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD6P30203 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD6P30203 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD6P30203 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD6P30203 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD6P30203 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD6P30203 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD6P30203 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD6P30203 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD6P30203 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD6P30203 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD6P30203 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD6P30203 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD6P30203 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD6P30203 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD6P30203 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD6P30203 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD6P30203 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD6P30203 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD6P30203 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD6P30203 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CD6P30203 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CD6P30203 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD6P30203 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD6P30203 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD6P30203 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD6P30203 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD6P30203 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD6P30203 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD6P30203 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD6P30203 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD6P30203 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD6P30203 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms