Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
HRCP23327 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
HRCP23327 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
HRCP23327 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
HRCP23327 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
HRCP23327 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
HRCP23327 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
HRCP23327 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
HRCP23327 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
HRCP23327 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
HRCP23327 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
HRCP23327 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
HRCP23327 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
HRCP23327 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
HRCP23327 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
HRCP23327 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
HRCP23327 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
HRCP23327 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
HRCP23327 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
HRCP23327 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
HRCP23327 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
HRCP23327 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
HRCP23327 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
HRCP23327 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
HRCP23327 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
HRCP23327 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
HRCP23327 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
HRCP23327 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
HRCP23327 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
HRCP23327 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
HRCP23327 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
HRCP23327 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
HRCP23327 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
HRCP23327 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
HRCP23327 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
HRCP23327 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
HRCP23327 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
HRCP23327 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
HRCP23327 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
HRCP23327 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
HRCP23327 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
HRCP23327 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
HRCP23327 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
HRCP23327 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
HRCP23327 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
HRCP23327 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
HRCP23327 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
HRCP23327 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
HRCP23327 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
HRCP23327 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
HRCP23327 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
HRCP23327 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
HRCP23327 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
HRCP23327 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
HRCP23327 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
HRCP23327 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
HRCP23327 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
HRCP23327 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
HRCP23327 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
HRCP23327 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
HRCP23327 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
HRCP23327 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
HRCP23327 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
HRCP23327 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
HRCP23327 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
HRCP23327 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
HRCP23327 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
HRCP23327 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
HRCP23327 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
HRCP23327 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
HRCP23327 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
HRCP23327 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
HRCP23327 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
HRCP23327 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
HRCP23327 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
HRCP23327 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
HRCP23327 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
HRCP23327 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
HRCP23327 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
HRCP23327 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
HRCP23327 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
HRCP23327 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HRCP23327 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
HRCP23327 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HRCP23327 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
HRCP23327 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
HRCP23327 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
HRCP23327 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
HRCP23327 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
HRCP23327 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
HRCP23327 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HRCP23327 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
HRCP23327 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
HRCP23327 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
HRCP23327 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
HRCP23327 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
HRCP23327 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
HRCP23327 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
HRCP23327 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
HRCP23327 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms