Protein–RNA interactions for Protein: P17181

IFNAR1, Interferon alpha/beta receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNAR1P17181 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
IFNAR1P17181 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
IFNAR1P17181 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IFNAR1P17181 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IFNAR1P17181 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
IFNAR1P17181 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFNAR1P17181 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFNAR1P17181 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFNAR1P17181 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
IFNAR1P17181 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFNAR1P17181 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFNAR1P17181 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IFNAR1P17181 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms