Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ESRRAP11474 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ESRRAP11474 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ESRRAP11474 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ESRRAP11474 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ESRRAP11474 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms