Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC4LP0CB38 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC4LP0CB38 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PABPC4LP0CB38 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PABPC4LP0CB38 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PABPC4LP0CB38 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms