Protein–RNA interactions for Protein: P0C851

PIRT, Phosphoinositide-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIRTP0C851 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIRTP0C851 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIRTP0C851 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIRTP0C851 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIRTP0C851 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PIRTP0C851 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms