Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NGFRP08138 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NGFRP08138 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NGFRP08138 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NGFRP08138 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NGFRP08138 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NGFRP08138 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NGFRP08138 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NGFRP08138 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NGFRP08138 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NGFRP08138 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NGFRP08138 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NGFRP08138 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NGFRP08138 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NGFRP08138 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NGFRP08138 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NGFRP08138 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NGFRP08138 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NGFRP08138 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NGFRP08138 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NGFRP08138 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NGFRP08138 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NGFRP08138 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGFRP08138 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGFRP08138 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGFRP08138 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGFRP08138 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NGFRP08138 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGFRP08138 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGFRP08138 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NGFRP08138 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NGFRP08138 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGFRP08138 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGFRP08138 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGFRP08138 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NGFRP08138 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NGFRP08138 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NGFRP08138 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGFRP08138 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NGFRP08138 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NGFRP08138 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NGFRP08138 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NGFRP08138 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGFRP08138 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGFRP08138 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NGFRP08138 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGFRP08138 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGFRP08138 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NGFRP08138 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NGFRP08138 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NGFRP08138 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NGFRP08138 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NGFRP08138 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NGFRP08138 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NGFRP08138 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NGFRP08138 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NGFRP08138 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGFRP08138 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGFRP08138 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGFRP08138 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGFRP08138 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGFRP08138 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGFRP08138 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NGFRP08138 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGFRP08138 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGFRP08138 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGFRP08138 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGFRP08138 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NGFRP08138 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NGFRP08138 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGFRP08138 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGFRP08138 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGFRP08138 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGFRP08138 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGFRP08138 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NGFRP08138 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGFRP08138 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGFRP08138 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NGFRP08138 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NGFRP08138 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NGFRP08138 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NGFRP08138 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NGFRP08138 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NGFRP08138 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NGFRP08138 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NGFRP08138 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NGFRP08138 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NGFRP08138 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NGFRP08138 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NGFRP08138 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NGFRP08138 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NGFRP08138 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NGFRP08138 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NGFRP08138 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NGFRP08138 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NGFRP08138 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NGFRP08138 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NGFRP08138 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NGFRP08138 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NGFRP08138 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms