Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFTPBP07988 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SFTPBP07988 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SFTPBP07988 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SFTPBP07988 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPBP07988 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms