Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB2P05107 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB2P05107 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB2P05107 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB2P05107 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB2P05107 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB2P05107 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB2P05107 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB2P05107 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB2P05107 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB2P05107 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB2P05107 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB2P05107 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB2P05107 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGB2P05107 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGB2P05107 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms