Protein–RNA interactions for Protein: P04626

ERBB2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB2P04626 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB2P04626 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB2P04626 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB2P04626 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB2P04626 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ERBB2P04626 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ERBB2P04626 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERBB2P04626 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERBB2P04626 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERBB2P04626 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB2P04626 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERBB2P04626 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB2P04626 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB2P04626 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERBB2P04626 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB2P04626 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERBB2P04626 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB2P04626 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB2P04626 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB2P04626 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB2P04626 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERBB2P04626 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB2P04626 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB2P04626 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB2P04626 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ERBB2P04626 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERBB2P04626 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ERBB2P04626 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERBB2P04626 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms