Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRM2P04554 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRM2P04554 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRM2P04554 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRM2P04554 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRM2P04554 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRM2P04554 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRM2P04554 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRM2P04554 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRM2P04554 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRM2P04554 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRM2P04554 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRM2P04554 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRM2P04554 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRM2P04554 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRM2P04554 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRM2P04554 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRM2P04554 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRM2P04554 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRM2P04554 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRM2P04554 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRM2P04554 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRM2P04554 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRM2P04554 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRM2P04554 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRM2P04554 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRM2P04554 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRM2P04554 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRM2P04554 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRM2P04554 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRM2P04554 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRM2P04554 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRM2P04554 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRM2P04554 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRM2P04554 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRM2P04554 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRM2P04554 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRM2P04554 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM2P04554 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PRM2P04554 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRM2P04554 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM2P04554 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM2P04554 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRM2P04554 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRM2P04554 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM2P04554 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM2P04554 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM2P04554 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM2P04554 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM2P04554 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM2P04554 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM2P04554 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM2P04554 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRM2P04554 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM2P04554 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM2P04554 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRM2P04554 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM2P04554 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM2P04554 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM2P04554 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM2P04554 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM2P04554 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRM2P04554 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM2P04554 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM2P04554 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM2P04554 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM2P04554 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRM2P04554 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRM2P04554 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRM2P04554 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRM2P04554 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRM2P04554 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRM2P04554 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRM2P04554 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRM2P04554 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRM2P04554 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRM2P04554 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRM2P04554 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRM2P04554 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRM2P04554 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRM2P04554 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM2P04554 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM2P04554 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM2P04554 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM2P04554 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM2P04554 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM2P04554 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM2P04554 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRM2P04554 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM2P04554 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM2P04554 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM2P04554 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM2P04554 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM2P04554 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRM2P04554 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM2P04554 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM2P04554 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRM2P04554 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRM2P04554 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRM2P04554 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms