Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRUB2O95900 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRUB2O95900 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRUB2O95900 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRUB2O95900 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRUB2O95900 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRUB2O95900 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRUB2O95900 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRUB2O95900 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRUB2O95900 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRUB2O95900 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRUB2O95900 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRUB2O95900 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRUB2O95900 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRUB2O95900 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRUB2O95900 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRUB2O95900 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRUB2O95900 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRUB2O95900 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRUB2O95900 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRUB2O95900 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRUB2O95900 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRUB2O95900 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRUB2O95900 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRUB2O95900 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRUB2O95900 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms