Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF6O94906 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRPF6O94906 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF6O94906 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRPF6O94906 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF6O94906 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF6O94906 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF6O94906 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms