Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC4O75487 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC4O75487 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC4O75487 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC4O75487 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC4O75487 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC4O75487 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC4O75487 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC4O75487 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC4O75487 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC4O75487 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC4O75487 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC4O75487 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC4O75487 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC4O75487 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC4O75487 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC4O75487 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC4O75487 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC4O75487 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC4O75487 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC4O75487 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC4O75487 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC4O75487 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC4O75487 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC4O75487 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC4O75487 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC4O75487 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPC4O75487 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPC4O75487 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPC4O75487 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC4O75487 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GPC4O75487 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC4O75487 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GPC4O75487 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC4O75487 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPC4O75487 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC4O75487 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC4O75487 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPC4O75487 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GPC4O75487 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GPC4O75487 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC4O75487 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPC4O75487 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC4O75487 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC4O75487 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC4O75487 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPC4O75487 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC4O75487 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC4O75487 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC4O75487 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPC4O75487 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC4O75487 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC4O75487 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC4O75487 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC4O75487 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC4O75487 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPC4O75487 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC4O75487 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC4O75487 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPC4O75487 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC4O75487 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC4O75487 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC4O75487 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC4O75487 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC4O75487 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPC4O75487 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC4O75487 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GPC4O75487 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPC4O75487 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC4O75487 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC4O75487 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC4O75487 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC4O75487 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPC4O75487 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC4O75487 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPC4O75487 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC4O75487 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC4O75487 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC4O75487 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC4O75487 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPC4O75487 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC4O75487 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC4O75487 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC4O75487 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPC4O75487 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC4O75487 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPC4O75487 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC4O75487 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPC4O75487 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC4O75487 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC4O75487 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC4O75487 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC4O75487 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC4O75487 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC4O75487 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC4O75487 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC4O75487 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPC4O75487 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC4O75487 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPC4O75487 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms