Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F6O75461 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F6O75461 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F6O75461 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F6O75461 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F6O75461 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F6O75461 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F6O75461 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F6O75461 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F6O75461 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F6O75461 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F6O75461 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F6O75461 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F6O75461 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F6O75461 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F6O75461 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F6O75461 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F6O75461 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F6O75461 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E2F6O75461 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F6O75461 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F6O75461 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F6O75461 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E2F6O75461 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F6O75461 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F6O75461 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
E2F6O75461 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F6O75461 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F6O75461 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E2F6O75461 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F6O75461 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F6O75461 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E2F6O75461 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F6O75461 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F6O75461 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E2F6O75461 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F6O75461 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E2F6O75461 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E2F6O75461 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F6O75461 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F6O75461 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F6O75461 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E2F6O75461 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E2F6O75461 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F6O75461 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F6O75461 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E2F6O75461 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
E2F6O75461 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F6O75461 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F6O75461 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F6O75461 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
E2F6O75461 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
E2F6O75461 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F6O75461 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F6O75461 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F6O75461 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F6O75461 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
E2F6O75461 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F6O75461 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F6O75461 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F6O75461 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
E2F6O75461 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F6O75461 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F6O75461 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F6O75461 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F6O75461 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
E2F6O75461 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F6O75461 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F6O75461 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
E2F6O75461 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F6O75461 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
E2F6O75461 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
E2F6O75461 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F6O75461 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F6O75461 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F6O75461 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
E2F6O75461 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F6O75461 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F6O75461 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F6O75461 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F6O75461 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F6O75461 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F6O75461 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
E2F6O75461 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F6O75461 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F6O75461 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F6O75461 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E2F6O75461 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F6O75461 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F6O75461 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F6O75461 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E2F6O75461 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F6O75461 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E2F6O75461 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F6O75461 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F6O75461 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F6O75461 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E2F6O75461 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E2F6O75461 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F6O75461 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms