Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT3O75175 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT3O75175 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT3O75175 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNOT3O75175 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNOT3O75175 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms