Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FABP7O15540 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FABP7O15540 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FABP7O15540 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FABP7O15540 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FABP7O15540 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FABP7O15540 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FABP7O15540 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FABP7O15540 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FABP7O15540 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FABP7O15540 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FABP7O15540 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FABP7O15540 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FABP7O15540 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FABP7O15540 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FABP7O15540 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FABP7O15540 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FABP7O15540 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FABP7O15540 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FABP7O15540 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FABP7O15540 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FABP7O15540 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FABP7O15540 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FABP7O15540 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FABP7O15540 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FABP7O15540 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FABP7O15540 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FABP7O15540 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FABP7O15540 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FABP7O15540 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FABP7O15540 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FABP7O15540 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FABP7O15540 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FABP7O15540 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FABP7O15540 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FABP7O15540 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FABP7O15540 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FABP7O15540 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FABP7O15540 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FABP7O15540 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FABP7O15540 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FABP7O15540 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FABP7O15540 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FABP7O15540 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FABP7O15540 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FABP7O15540 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FABP7O15540 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FABP7O15540 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FABP7O15540 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FABP7O15540 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FABP7O15540 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FABP7O15540 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FABP7O15540 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FABP7O15540 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FABP7O15540 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FABP7O15540 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FABP7O15540 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FABP7O15540 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FABP7O15540 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FABP7O15540 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FABP7O15540 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FABP7O15540 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FABP7O15540 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FABP7O15540 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FABP7O15540 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FABP7O15540 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FABP7O15540 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FABP7O15540 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FABP7O15540 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FABP7O15540 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FABP7O15540 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FABP7O15540 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FABP7O15540 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FABP7O15540 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FABP7O15540 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FABP7O15540 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FABP7O15540 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FABP7O15540 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FABP7O15540 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FABP7O15540 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FABP7O15540 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FABP7O15540 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FABP7O15540 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FABP7O15540 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FABP7O15540 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FABP7O15540 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FABP7O15540 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FABP7O15540 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FABP7O15540 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FABP7O15540 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FABP7O15540 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FABP7O15540 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FABP7O15540 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FABP7O15540 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FABP7O15540 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FABP7O15540 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FABP7O15540 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FABP7O15540 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FABP7O15540 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FABP7O15540 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms