Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
N4BP3O15049 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
N4BP3O15049 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
N4BP3O15049 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP3O15049 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
N4BP3O15049 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
N4BP3O15049 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
N4BP3O15049 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
N4BP3O15049 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
N4BP3O15049 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
N4BP3O15049 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
N4BP3O15049 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
N4BP3O15049 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
N4BP3O15049 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
N4BP3O15049 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
N4BP3O15049 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
N4BP3O15049 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
N4BP3O15049 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms