Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3KRW8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3KRW8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3KRW8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3KRW8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3KRW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3KRW8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3KRW8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KRW8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KRW8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KRW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KRW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KRW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KRW8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KRW8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3KRW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3KRW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KRW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KRW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KRW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KRW8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KRW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KRW8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KRW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KRW8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KRW8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KRW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KRW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KRW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KRW8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KRW8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KRW8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KRW8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KRW8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KRW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KRW8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KRW8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KRW8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KRW8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KRW8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KRW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KRW8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KRW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KRW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KRW8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KRW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KRW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
J3KRW8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3KRW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3KRW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3KRW8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3KRW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3KRW8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3KRW8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KRW8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KRW8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KRW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KRW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KRW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KRW8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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