Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3KRW8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3KRW8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
J3KRW8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3KRW8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3KRW8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
J3KRW8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3KRW8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KRW8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KRW8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KRW8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KRW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KRW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KRW8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KRW8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3KRW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3KRW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KRW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KRW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KRW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KRW8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KRW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KRW8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3KRW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3KRW8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KRW8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KRW8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3KRW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KRW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KRW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KRW8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3KRW8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3KRW8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KRW8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KRW8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
J3KRW8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
J3KRW8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KRW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
J3KRW8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
J3KRW8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KRW8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KRW8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
J3KRW8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KRW8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KRW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
J3KRW8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KRW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KRW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KRW8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KRW8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
J3KRW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
J3KRW8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3KRW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3KRW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3KRW8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
J3KRW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
J3KRW8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
J3KRW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3KRW8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
J3KRW8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KRW8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KRW8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KRW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KRW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
J3KRW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
J3KRW8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms