Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBAL3A6NHL2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBAL3A6NHL2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBAL3A6NHL2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBAL3A6NHL2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBAL3A6NHL2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms