Protein–RNA interactions for Protein: A6NFX1

MFSD2B, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2BA6NFX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms