Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PGPEP1LA6NFU8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PGPEP1LA6NFU8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGPEP1LA6NFU8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGPEP1LA6NFU8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PGPEP1LA6NFU8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PGPEP1LA6NFU8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PGPEP1LA6NFU8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGPEP1LA6NFU8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PGPEP1LA6NFU8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGPEP1LA6NFU8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGPEP1LA6NFU8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGPEP1LA6NFU8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGPEP1LA6NFU8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PGPEP1LA6NFU8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms