Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PSDA5PKW4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PSDA5PKW4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PSDA5PKW4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PSDA5PKW4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PSDA5PKW4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PSDA5PKW4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PSDA5PKW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PSDA5PKW4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PSDA5PKW4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PSDA5PKW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PSDA5PKW4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PSDA5PKW4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PSDA5PKW4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PSDA5PKW4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PSDA5PKW4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PSDA5PKW4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PSDA5PKW4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PSDA5PKW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PSDA5PKW4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PSDA5PKW4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PSDA5PKW4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PSDA5PKW4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PSDA5PKW4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PSDA5PKW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
PSDA5PKW4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PSDA5PKW4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PSDA5PKW4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PSDA5PKW4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PSDA5PKW4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PSDA5PKW4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PSDA5PKW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PSDA5PKW4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PSDA5PKW4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
PSDA5PKW4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PSDA5PKW4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PSDA5PKW4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
PSDA5PKW4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PSDA5PKW4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PSDA5PKW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PSDA5PKW4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PSDA5PKW4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PSDA5PKW4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PSDA5PKW4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PSDA5PKW4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PSDA5PKW4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PSDA5PKW4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PSDA5PKW4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSDA5PKW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PSDA5PKW4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSDA5PKW4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSDA5PKW4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PSDA5PKW4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms