Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM9

MEIKIN, Meiosis-specific kinetochore protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIKINA0A087WXM9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MEIKINA0A087WXM9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MEIKINA0A087WXM9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIKINA0A087WXM9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MEIKINA0A087WXM9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MEIKINA0A087WXM9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIKINA0A087WXM9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MEIKINA0A087WXM9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIKINA0A087WXM9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIKINA0A087WXM9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIKINA0A087WXM9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MEIKINA0A087WXM9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIKINA0A087WXM9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIKINA0A087WXM9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MEIKINA0A087WXM9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms