Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQ87 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQ87 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQ87 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQ87 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQ87 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQ87 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQ87 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQ87 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQ87 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQ87 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQ87 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQ87 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQ87 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQ87 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQ87 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQ87 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQ87 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQ87 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQ87 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U3KQ87 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
U3KQ87 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQ87 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U3KQ87 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQ87 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQ87 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U3KQ87 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U3KQ87 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U3KQ87 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQ87 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQ87 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQ87 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQ87 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQ87 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U3KQ87 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQ87 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQ87 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U3KQ87 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQ87 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U3KQ87 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQ87 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQ87 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U3KQ87 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U3KQ87 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U3KQ87 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQ87 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQ87 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U3KQ87 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQ87 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQ87 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U3KQ87 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQ87 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
U3KQ87 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U3KQ87 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQ87 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U3KQ87 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQ87 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U3KQ87 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
U3KQ87 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQ87 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQ87 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQ87 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQ87 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQ87 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U3KQ87 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQ87 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQ87 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U3KQ87 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQ87 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U3KQ87 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U3KQ87 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQ87 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQ87 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQ87 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U3KQ87 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U3KQ87 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
U3KQ87 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
U3KQ87 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQ87 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQ87 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQ87 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U3KQ87 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U3KQ87 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQ87 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQ87 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQ87 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
U3KQ87 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
U3KQ87 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQ87 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQ87 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQ87 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQ87 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQ87 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
U3KQ87 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQ87 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQ87 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQ87 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQ87 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQ87 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
U3KQ87 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms