Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX11Q9Y5W9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX11Q9Y5W9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX11Q9Y5W9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX11Q9Y5W9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX11Q9Y5W9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX11Q9Y5W9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX11Q9Y5W9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms