Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMM9Q9Y5J7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TIMM9Q9Y5J7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMM9Q9Y5J7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TIMM9Q9Y5J7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TIMM9Q9Y5J7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TIMM9Q9Y5J7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM9Q9Y5J7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM9Q9Y5J7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM9Q9Y5J7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TIMM9Q9Y5J7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms