Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y371

SH3GLB1, Endophilin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB1Q9Y371 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3GLB1Q9Y371 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH3GLB1Q9Y371 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3GLB1Q9Y371 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SH3GLB1Q9Y371 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3GLB1Q9Y371 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3GLB1Q9Y371 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH3GLB1Q9Y371 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3GLB1Q9Y371 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3GLB1Q9Y371 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3GLB1Q9Y371 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3GLB1Q9Y371 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GLB1Q9Y371 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GLB1Q9Y371 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GLB1Q9Y371 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GLB1Q9Y371 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3GLB1Q9Y371 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms