Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VDAC3Q9Y277 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VDAC3Q9Y277 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VDAC3Q9Y277 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VDAC3Q9Y277 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VDAC3Q9Y277 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VDAC3Q9Y277 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms