Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PHTF1Q9UMS5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHTF1Q9UMS5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHTF1Q9UMS5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHTF1Q9UMS5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHTF1Q9UMS5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHTF1Q9UMS5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHTF1Q9UMS5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHTF1Q9UMS5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHTF1Q9UMS5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHTF1Q9UMS5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHTF1Q9UMS5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHTF1Q9UMS5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHTF1Q9UMS5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PHTF1Q9UMS5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms