Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMCC3Q9ULS5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMCC3Q9ULS5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMCC3Q9ULS5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCC3Q9ULS5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCC3Q9ULS5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMCC3Q9ULS5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMCC3Q9ULS5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms