Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PNMA8BQ9ULN7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNMA8BQ9ULN7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA8BQ9ULN7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA8BQ9ULN7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNMA8BQ9ULN7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA8BQ9ULN7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms