Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXNB3Q9ULL4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXNB3Q9ULL4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXNB3Q9ULL4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXNB3Q9ULL4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXNB3Q9ULL4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNB3Q9ULL4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms