Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF11Q9UIL8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF11Q9UIL8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHF11Q9UIL8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHF11Q9UIL8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PHF11Q9UIL8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PHF11Q9UIL8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHF11Q9UIL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms