Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHORDC1Q9UHD1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHORDC1Q9UHD1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHORDC1Q9UHD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHORDC1Q9UHD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHORDC1Q9UHD1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms