Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MAGEC2Q9UBF1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MAGEC2Q9UBF1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAGEC2Q9UBF1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MAGEC2Q9UBF1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MAGEC2Q9UBF1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAGEC2Q9UBF1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MAGEC2Q9UBF1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms