Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2L0

WDR35, WD repeat-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR35Q9P2L0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
WDR35Q9P2L0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
WDR35Q9P2L0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR35Q9P2L0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR35Q9P2L0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR35Q9P2L0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR35Q9P2L0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR35Q9P2L0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR35Q9P2L0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms