Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HIGD1BQ9P298 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HIGD1BQ9P298 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HIGD1BQ9P298 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIGD1BQ9P298 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HIGD1BQ9P298 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HIGD1BQ9P298 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1BQ9P298 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1BQ9P298 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1BQ9P298 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1BQ9P298 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1BQ9P298 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1BQ9P298 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIGD1BQ9P298 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1BQ9P298 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1BQ9P298 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms