Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAMSAP3Q9P1Y5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CAMSAP3Q9P1Y5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMSAP3Q9P1Y5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAMSAP3Q9P1Y5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAMSAP3Q9P1Y5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMSAP3Q9P1Y5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMSAP3Q9P1Y5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAMSAP3Q9P1Y5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAMSAP3Q9P1Y5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAMSAP3Q9P1Y5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAMSAP3Q9P1Y5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAMSAP3Q9P1Y5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAMSAP3Q9P1Y5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAMSAP3Q9P1Y5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CAMSAP3Q9P1Y5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAMSAP3Q9P1Y5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAMSAP3Q9P1Y5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAMSAP3Q9P1Y5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAMSAP3Q9P1Y5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms