Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1A2

PPP4R1L, Putative serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R1LQ9P1A2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP4R1LQ9P1A2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R1LQ9P1A2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP4R1LQ9P1A2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4R1LQ9P1A2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP4R1LQ9P1A2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP4R1LQ9P1A2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP4R1LQ9P1A2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms