Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UFSP2Q9NUQ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFSP2Q9NUQ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UFSP2Q9NUQ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFSP2Q9NUQ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms